Главная / ИТ и Технологии / Создана база данных пептидов из ядов животных, действующих на калиевые каналы

Создана база данных пептидов из ядов животных, действующих на калиевые каналы

Создана база данных пептидов из ядов животных, действующих на калиевые каналыАлексей Кузьменков

Российские ученые создали базу данных, которая объединяет все известные пептиды (полимеры из аминокислот), выделенные из ядов животных и действующие на калиевые каналы. Эти вещества способны связываться со своей молекулярной мишенью в мембране клеток и влиять на их работу. База данных позволит ученым ускорить поиск подходящих пептидов для разработки новых лекарств и упростит фундаментальные исследования калиевых каналов. Работа выполнена при поддержке гранта Президентской программы исследовательских проектов РНФ и опубликована в журнале Scientific Data. Калиевые каналы — это белки, находящиеся в мембране клеток и служащие своеобразными порами, через которые могут проходить только ионы калия. Калиевые каналы обнаружены практически у всех живых организмов. Они участвуют в таких процессах, как возникновение и проведение нервных импульсов, сокращение сердца и скелетной мускулатуры и многих других. Любое нарушение в структуре и работе этих белков опасно и может приводить к различным патологиям, от нейродегенеративных заболеваний до онкологических.

Существуют различные вещества, способные связываться с калиевыми каналами, их называют лигандами. Например, это могут быть ионы металлов, низкомолекулярные соединения и пептиды. Они могут затыкать пору канала или модифицировать его, в результате чего калиевый ток блокируется.

«Сейчас во всем мире ведется поиск и описание различных веществ, которые действуют на калиевые каналы, чтобы впоследствии на их основе разработать высокоэффективные препараты. Очень часто подобные вещества выделяют из лекарственных растений или из яда животных», — комментирует Алексей Кузьменков, кандидат химических наук, научный сотрудник лаборатории молекулярных инструментов для нейробиологии Института биоорганической химии имени академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова РАН.

Разработанная база данных Kalium 2.0 объединяет все пептиды-лиганды калиевых каналов, выделенные из ядов скорпионов, змей, пауков, морских беспозвоночных, пчел и многих других организмов. Эти лиганды достаточно прочно связываются с каналами. Взаимодействие пользователя с базой данных сосредоточено вокруг основной таблицы с информацией о лигандах калиевых каналов, отсортированных по таким параметрам, как группы организмов-источников полипептида, названия видов этих организмов, семейства полипептидов и некоторые другие.

«В Kalium 2.0 можно найти всю необходимую для исследователя информацию о конкретном лиганде, получить и выгрузить полную его характеристику, осуществить поиск по заданным параметрам. Главная особенность базы данных – проработанная и актуальная информация о физиологической активности того или иного лиганда. Мы собрали ее вручную примерно из 500 отдельных публикаций. С помощью базы данных нейробиологи и биохимики смогут решать ряд важных задач: от интерпретации собственных результатов до дизайна новых лекарственных субстанций», – заключает Алексей Кузьменков.

Источник Gazeta.ru

Подключение к HDTV онлайн!
x

Читайте также

Баннер футбольных фанатов, где Россия обвиняется в оккупации 20% территории Грузии

СК запросил проверку грузинского депутата "убившего русских"